Las consideraciones sistemáticas son algo complejas de desarrollar, principalmente por su naturaleza dinámica. Siendo parte de la ciencia como un todo, la sistemática es algo que siempre está en movimiento. Tiene la cualidad de ser evidencia clara del estado del conocimiento, y por ende, año a año va modificándose a medida que los estudios avanzan en los diferentes grupos. Posiblemente la sistemática plasmada en este trabajo sea distinta a la que se propondrá en el futuro.
Dentro de los vertebrados, los de la Clase Sauropsida incluye a los tetrápodos que vulgarmente llamamos reptiles y aves (Reptilia se puede utilizar como sinónimo de Sauropsida si lo usamos entendiendo que estamos incluyendo a los reptiles y las aves). Y dentro de los Sauropsida nos enfocaremos en el grupo de los Lepidosauria, el cual incluye dos agrupaciones: una muy reducida en cantidad de especies vivientes (los del orden Sphenodontia o Rhynchocephalia, con dos especies de tuataras, unos lagartos del género Sphenodon) y otra muy diversificada (los del orden Squamata).
Las serpientes son una agrupación que pertenece al clado de los Squamata, pero las relaciones filogenéticas no están del todo claras. Los ofidios contienen dos grupos: los Scolecophidia (viboritas ciegas) y los Alethinophidia (el resto de las serpientes).
La sistemática filogenética está basada en la indicada en Reptile Database (http://reptile-database.org/)
Phyllum Chordata
Clase Sauropsida
Superorden Lepidosauria
Orden Squamata
Ophidia (Serpentes)
Superfamilia Acrochordoidea
- Familia Acrochordidae
Superfamilia Uropeltoidea
- Familia Anomochilidae
- Familia Cylindrophiidae
- Familia Uropeltidae
Superfamilia Pythonoidea
- Familia Loxocemidae
- Familia Pythonidae
- Familia Xenopeltidae
Superfamilia Booidea
- Familia Boidae
- Subfamilia Boinae
- Subfamilia Ungaliophiinae
- Subfamilia Erycinae
- Subfamilia Calabariinae (o Calabariidae)
- Subfamilia Candoiinae (o Candoiidae)
- Subfamilia Sanziniinae (o Sanziniidae)
- Subfamilia Charininae (o Charinidae)
Superfamilia Colubroidea
- Familia Colubridae
- Subfamilia Calamariinae
- Subfamilia Colubrinae
- Subfamilia Dipsadinae (se la puede hallar como Dipsadidae, e.g. en Zaher et al. 2019)
- Subfamilia Grayiinae
- Subfamilia Natricinae (Se la puede hallar como Natricidae, e.g. en Zaher et al. 2019)
- Subfamilia Pseudoxenodontinae (Pseudoxenodontidae en Zaher et al. 2019)
- Subfamilia Sibynophiinae
Superfamilia Elapoidea
- Family Atractaspididae
- Subfamilia Aparallactinae
- Subfamilia Atractaspidinae
- Familia Cyclocoridae
- Familia Lamprophiidae
- Familia Prosymnidae
- Familia Psammophiidae
- Familia Pseudaspididae
- Familia Pseudoxyrhophiidae
- Familia Elapidae
- Subfamilia Elapinae
- Subfamilia Hydrophiinae
Superfamilia Typhlopoidea (Scolecophidia)
- Familia Anomalepididae
- Familia Gerrhopilidae
- Familia Typhlopidae
- Familia Leptotyphlopidae/Glauconiidae
- Subfamilia Leptotyphlopinae
- Subfamilia Epictinae
- Familia Xenotyphlopidae
Actualmente no asignadas a ninguna superfamilia:
- Familia Aniliidae/Ilysiidae
- Familia Bolyeriidae
- Familia Homalopsidae
- Familia Pareidae
- Familia Tropidophiidae
- Familia Viperidae
- Subfamilia Azemiopinae
- Subfamilia Crotalinae
- Subfamilia Viperinae
- Familia Xenodermidae
- Familia Xenophidiidae